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第一章:绪论 单元测验01
1、 以下哪个是今天“生物信息学”的正确英语拼写?
答案: bioinformatics
2、 以下哪位科学家获得了两次诺贝尔奖?
答案: 桑格(Frederick Sanger)
3、 被称为“DNA之父”的是哪位科学家?
答案: 沃森(James Waston)
4、 被称为“计算机之父,人工智能之父”的是哪位科学家?
答案: 图灵(Alan Mathison Turing)
5、 被称为“现代实验生物学奠基人”的是哪位科学家?
答案: 摩尔根(Thomas H. Morgen )
6、 被称为“遗传学的奠基人,现代遗传学之父”的是哪位科学家?
答案: 孟德尔(Gregor J. Mendel)
7、 谁是第一个提出“计算机”这个概念的人?
答案: 莱布尼兹(Gottfried W Leibniz)
8、 DNA双螺旋结构的解析与下列哪些人有关?
答案: 沃森(James Waston);
克里克(Francis Crick);
威尔金斯(Maurice Wilkins);
弗兰克林(Rosalind Franklin)
第二章:生物数据库(第一部分) 单元测验02
1、 FASTA序列格式以哪个符号开头?
答案: >
2、 从GenBank的哪一项注释中可以找到关于编码蛋白的信息?
答案: CDS
3、 以下关于GenBank的描述,哪个是正确的?
答案: GenBank里的一条数据库记录可能只包含某个基因的一部分。;
真核生物的基因经常是分段存储在多条GenBank数据库记录里。
4、 以下哪个是NCBI下属的数据库?
答案: GenBank;
RefSeq;
Gene;
dbEST;
ncRNA
5、 关于HMP的描述,以下哪个是正确的?
答案: HMP是人类微生物组学计划
6、 以下关于PubMed的描述错误的是
答案: 任何生命科学领域的论文都可以从PubMed下载全文
7、 以下哪些数据库是核酸数据库?
答案: GenBank;
EMBL-ENA;
DDBJ;
NCBI-Gene
8、 以下关系式正确的是?
答案: 1G=1,000,000K;
1T=1,000G;
1T=1,000,000,000K;
1T=1,000,000M;
1G=1,000M
9、 GenBank数据库中的检索号(Accession)和基因座名(Locus)指的都是一条序列在数据库中的编号,他们永远都是相同的。
答案: 错误
10、 当一个序列发生了改变,它的GenBank检索号(Accession)不变,但会被赋予一个新的GI号。
答案: 正确
11、 对于GenBank的一条数据库记录,只要版本号(Version)增加,必然会产生一个新的GI号。
答案: 正确
12、 GenBank里的一个序列因发生变化而被赋予新的GI号时,检索号(Accession)和版本号(Version)都不发生改变。
答案: 错误
第二章:生物数据库(第二部分) 单元测验03
1、 以下关于Swiss-Prot数据库和TrEMBL数据库的描述错误的是:
答案: TrEMBL数据量大,其中也包含Swiss-Prot里的序列;
Swiss-Port是自动完成的注释,TrEMBL是手动完成的注释
2、 以下哪个生物数据库提供信号传导通路信息?
答案: KEGG;
KEGG Pathway
3、 以下不是非冗余的蛋白质/核酸数据库的是:
答案: UniProtKB TrEMBL
4、 全世界唯一存储生物大分子3D结构的数据库是:
答案: PDB
5、 PDB文件是如何存储蛋白质3D结构的?
答案: 通过存储蛋白质中每个原子的3D坐标
6、 以下哪种方法解析的蛋白质结构不可以提交到PDB数据库?
答案: 计算方法预测的结构模型
7、 以下哪些是蛋白质数据库?
答案: Swiss-Prot;
TrEMBL;
PIR;
CATH;
SCOP2;
PDB
8、 下列关于生物数据库描述正确的是:
答案: NCBI-GenBank、EMBL-ENA和DDBJ这三个数据库的数据通过“国际核酸序列数据库 联盟(INSDC)实时共享;
Swiss-Prot和TrEMBL同属于UniProtKB,他们的区别是,前者是手动完成的注释, 后者是自动完成的注释;
PIR、Swiss-Prott、TrEMBL均属于蛋白质序列数据库
9、 以下哪些是关于蛋白质结构分类的数据库?
答案: CATH;
SCOP2;
SCOP
10、 以下关于PDB数据库描述正确的是:
答案: PDB数据库是一级蛋白质数据库;
PDB数据库存储大分子的3D结构;
PDB数据库里既包含蛋白质的3D结构,也包含核酸的3D结构,以及二者的复合体结构;
PDB数据库里只包含实验方法解析的大分子3D结构
第三章:序列比较(第一部分) 单元测验04
1、 以下关于转换和颠换描述错误的是?
答案: G变T是转换
2、 假设两个蛋白质序列的相似度在20%左右,那么应该采用的PAM矩阵是?
答案: PAM250
3、 假设你有两条亲缘关系很近的蛋白质序列。为了更好的比较它们,最好使用下列哪个BLOSUM或PAM矩阵?
答案: BLOSUM80或PAM25
4、 以下矩阵不属于蛋白质序列比对的替换积分矩阵的是?
答案: 转换-颠换矩阵
5、 根据下面的全局比对结果,计算出这两条序列的一致度。
答案: 50%
6、 根据下面的全局比对结果,计算出这两条序列的相似度。(是否相似参考下面的BLOSUME62替换记分矩阵)BLOSUME62替换记分矩阵
答案: 70%
第三章:序列比较(第二部分) 单元测验05
1、 BLAST是什么?
答案: 数据库中搜索相似序列的工具
2、 关于tBLASTn描述正确的是:
答案: 是一个为蛋白质序列进行相似性搜索的工具;
其搜索的数据库是核酸数据库;
其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列
3、 关于tBLASTx描述正确的是:
答案: 是一个为核酸序列进行相似性搜索的工具 ;
其搜索的数据库是核酸数据库;
其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列;
要进行相似性搜索的核酸序列需要先被翻译成6条蛋白质序列
4、 要搜索与某条蛋白质序列相似的并符合某种模式的序列,应该选用的方法是:
答案: phi-BLASTp
5、 要在核酸数据库查询一段与某DNA序列可能编码的蛋白质最相似的序列,应选择:
答案: tBLASTx
6、 两条序列,绝大部分区域都很相似,只是其中一条序列的一个功能区在另一条序列中是缺失的。如果想要通过双序列比对把这个功能区找出来,我们应该怎么设置gap?
答案: gap_open大,gap_extend小
7、 如果你想通过一条蛋白质序列从蛋白质数据库中搜索出一个庞大的蛋白质家族,应该用:
答案: psi-blastp
8、 序列 MGEGGLATA 符合正则表达式 {L}GEx[GAS][LIVM]x(3,7) 。其中{}代表除什么以外,[]代表其中之一,x代表任意字母,(3,7)代表3到7个前面的某字符。
答案: 正确
9、 序列 FGETAIII 符合正则表达式 {L}GEx[GAS][LIVM]x(3,7) 。其中{}代表除什么以外,[]代表其中之一,x代表任意字母,(3,7)代表3到7个前面的某字符。
答案: 错误
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